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qPCR 技術(shù)重要的參數(shù)指標(biāo)解析

日期:2024-11-25 01:22
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摘要: qPCR 技術(shù)重要的參數(shù)指標(biāo)解析: 1、擴(kuò)增及溶解曲線: 擴(kuò)增曲線是PCR過程中,以循環(huán)數(shù)為橫坐標(biāo),以熒光強(qiáng)度為縱坐標(biāo)所繪制的曲線。主要用于反映qPCR的動(dòng)態(tài)進(jìn)程;溶解曲線是用來驗(yàn)證擴(kuò)增產(chǎn)物特異性的,如果產(chǎn)物是單一條帶,溶解曲線就會(huì)出現(xiàn)單峰,如果有引物二聚體或其它非特異性擴(kuò)增,就會(huì)出現(xiàn)至少兩個(gè)峰。 2、熒光域值(threshold): 是在熒光擴(kuò)增曲線上人為設(shè)定的一個(gè)值,它可以設(shè)定在熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段任意位置上,但一般熒光域值...

qPCR 技術(shù)重要的參數(shù)指標(biāo)解析:




1、擴(kuò)增及溶解曲線:

擴(kuò)增曲線是PCR過程中,以循環(huán)數(shù)為橫坐標(biāo),以熒光強(qiáng)度為縱坐標(biāo)所繪制的曲線。主要用于反映qPCR的動(dòng)態(tài)進(jìn)程;溶解曲線是用來驗(yàn)證擴(kuò)增產(chǎn)物特異性的,如果產(chǎn)物是單一條帶,溶解曲線就會(huì)出現(xiàn)單峰,如果有引物二聚體或其它非特異性擴(kuò)增,就會(huì)出現(xiàn)至少兩個(gè)峰。




2、熒光域值(threshold): 

是在熒光擴(kuò)增曲線上人為設(shè)定的一個(gè)值,它可以設(shè)定在熒光信號(hào)指數(shù)擴(kuò)增階段任意位置上,但一般熒光域值的缺省設(shè)置是PCR反應(yīng)前3-15個(gè)循環(huán)熒光信號(hào)標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,即:threshold。




3、Ct 值:

是指每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定域值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。將已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品梯度稀釋進(jìn)行qPCR,按照起始DNA量由多到少的順序等間隔得到一系列擴(kuò)增曲線。Ct值與起始模板數(shù)的對(duì)數(shù)值之間存在線性關(guān)系,可以制作標(biāo)準(zhǔn)曲線。未知濃度的樣品也得到Ct值,代入標(biāo)準(zhǔn)曲線,就可以求出未知樣品的起始模板量。