PCR引物長度介紹
日期：2024-11-25 00:40
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摘要：
一般引物長度為18~30堿基?？偟恼f來，決定引物退火溫度（Tm值）zui重要的因素就是引物的長度。有以下公式可以用于粗略計(jì)算引物的退火溫度。
在引物長度小于20bp時(shí)：[4(G+C)+2(A+T)]-5℃
在引物長度大于20bp時(shí)：62.3℃+0.41℃(%G-C)-500/length-5℃
另外有許多軟件也可以對退火溫度進(jìn)行計(jì)算，其計(jì)算原理會各有不同，因此有時(shí)計(jì)算出的數(shù)值可能會有少量差距。為了優(yōu)化PCR反應(yīng)，使用確保退火溫度不低于54℃的zui短的引物可獲得zui好的效率和特異性。
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一般引物長度為18~30堿基。總的說來，決定引物退火溫度（Tm值）zui重要的因素就是引物的長度。有以下公式可以用于粗略計(jì)算引物的退火溫度。
在引物長度小于20bp時(shí)：[4(G+C)+2(A+T)]-5℃
在引物長度大于20bp時(shí)：62.3℃+0.41℃(%G-C)-500/length-5℃
另外有許多軟件也可以對退火溫度進(jìn)行計(jì)算，其計(jì)算原理會各有不同，因此有時(shí)計(jì)算出的數(shù)值可能會有少量差距。為了優(yōu)化PCR反應(yīng)，使用確保退火溫度不低于54℃的zui短的引物可獲得zui好的效率和特異性。
總的說來，每增加一個(gè)核苷酸引物特異性提高4倍，這樣，大多數(shù)應(yīng)用的zui短引物長度為18個(gè)核苷酸。引物長度的上限并不很重要，主要與反應(yīng)效率有關(guān)。由于熵的原因，引物越長，它退火結(jié)合到靶DNA上形成供DNA聚合酶結(jié)合的穩(wěn)定雙鏈模板的速率越小。